More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2889 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2889  ferrochelatase  100 
 
 
339 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00549104  normal  0.445564 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1945  ferrochelatase  69.49 
 
 
343 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3023  ferrochelatase  58.89 
 
 
360 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.717829  normal  0.96157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3249  ferrochelatase  58.81 
 
 
343 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1691  ferrochelatase  59.81 
 
 
335 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0259091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2301  ferrochelatase  56.08 
 
 
322 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.198749 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1407  ferrochelatase  54.49 
 
 
350 aa  345  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.957643  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6777  Ferrochelatase  55.75 
 
 
332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2913  ferrochelatase  53.58 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.02431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1624  ferrochelatase  53.92 
 
 
363 aa  325  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.220576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2498  ferrochelatase  51.32 
 
 
341 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2182  ferrochelatase  52.85 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22320  ferrochelatase  52.45 
 
 
350 aa  318  7.999999999999999e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0799784  normal  0.237967 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15200  ferrochelatase  53.31 
 
 
449 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.349388  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2768  ferrochelatase  53.21 
 
 
426 aa  315  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00310189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1552  ferrochelatase  52.31 
 
 
380 aa  311  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1905  ferrochelatase  48.15 
 
 
370 aa  309  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2106  ferrochelatase  51.49 
 
 
373 aa  296  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2232  ferrochelatase  53.21 
 
 
421 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180991  decreased coverage  0.00658585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1902  ferrochelatase  51.08 
 
 
362 aa  294  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138282  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2495  ferrochelatase  47.29 
 
 
346 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2754  ferrochelatase  48.92 
 
 
339 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.6555  normal  0.146848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2458  ferrochelatase  46.99 
 
 
346 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2503  ferrochelatase  46.99 
 
 
346 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2490  ferrochelatase  51.68 
 
 
421 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000132256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3656  ferrochelatase  47.37 
 
 
340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314821  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1088  ferrochelatase  51.36 
 
 
381 aa  282  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403919  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2083  ferrochelatase  49.11 
 
 
338 aa  278  7e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170276  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26780  ferrochelatase  45.4 
 
 
385 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1886  Ferrochelatase  44.72 
 
 
383 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2409  ferrochelatase  46.46 
 
 
374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2407  Ferrochelatase  49.38 
 
 
393 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333356  hitchhiker  0.00311983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2624  Ferrochelatase  45.98 
 
 
381 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08340  ferrochelatase  47.26 
 
 
395 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.145671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1545  Ferrochelatase  48.47 
 
 
407 aa  252  7e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.494252  normal  0.520149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11514  ferrochelatase  46.87 
 
 
344 aa  250  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.20326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15820  ferrochelatase  45.22 
 
 
384 aa  236  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0363986  normal  0.0505419 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1519  Ferrochelatase  38.58 
 
 
338 aa  193  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2930  ferrochelatase  33.74 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1749  ferrochelatase  33.33 
 
 
313 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.665949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3547  ferrochelatase  30.79 
 
 
305 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4517  ferrochelatase  30.35 
 
 
387 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000264771  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  30.21 
 
 
387 aa  145  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2029  ferrochelatase  33.33 
 
 
313 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  30.72 
 
 
387 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0173  ferrochelatase  31.72 
 
 
319 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1466  ferrochelatase  29.07 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0650  ferrochelatase  28.75 
 
 
310 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.540863  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  28.7 
 
 
387 aa  139  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0019  ferrochelatase  31.64 
 
 
317 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  28.57 
 
 
387 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2991  ferrochelatase  31.63 
 
 
318 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0694  ferrochelatase  32.38 
 
 
303 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1405  ferrochelatase  33.03 
 
 
336 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.431534  normal  0.201905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3312  ferrochelatase  31.85 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00205193  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2090  ferrochelatase  31.85 
 
 
306 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1198  ferrochelatase  28.61 
 
 
443 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  28.27 
 
 
388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1857  ferrochelatase  29.55 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.89761  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05821  ferrochelatase  29.55 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  29.48 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  29.48 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0825  ferrochelatase  30.06 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.769229  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1367  ferrochelatase  25.24 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.668647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0039  ferrochelatase  29.74 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2591  ferrochelatase  31.55 
 
 
320 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07661  ferrochelatase  31.14 
 
 
391 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0342613 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  30.21 
 
 
391 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  30.3 
 
 
391 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  26.65 
 
 
391 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2715  ferrochelatase  31.04 
 
 
322 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  26.95 
 
 
391 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  26.87 
 
 
391 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0038  ferrochelatase  29.45 
 
 
317 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0641223 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01700  ferrochelatase, putative  28.53 
 
 
413 aa  124  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  26.43 
 
 
391 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2831  predicted protein  28.53 
 
 
366 aa  123  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00315896  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1920  ferrochelatase  24.13 
 
 
307 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1886  ferrochelatase  24.13 
 
 
307 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0193223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0873  ferrochelatase  25.54 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000348204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4133  ferrochelatase  26.67 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05281  ferrochelatase  26.53 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1208  ferrochelatase  26.98 
 
 
319 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1054  ferrochelatase  26.46 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000372752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1260  ferrochelatase  26.03 
 
 
319 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000115396  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1503  ferrochelatase  26.52 
 
 
312 aa  117  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1311  ferrochelatase  26.15 
 
 
319 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000651195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1168  ferrochelatase  26.73 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1000  ferrochelatase  26.73 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1075  ferrochelatase  26.52 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00091375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0985  ferrochelatase  26.73 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0987  ferrochelatase  26.73 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1153  ferrochelatase  26.73 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1071  ferrochelatase  26.73 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1158  ferrochelatase  26.52 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0772321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1104  ferrochelatase  26.73 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07752  mitochondrial ferrochelatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07750)  26.65 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.412365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1231  ferrochelatase  26.73 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2474  ferrochelatase  31.33 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0132426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4201  ferrochelatase  26.73 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>