More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2409 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2409  ferrochelatase  100 
 
 
374 aa  756    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2182  ferrochelatase  56.79 
 
 
344 aa  388  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22320  ferrochelatase  57.1 
 
 
350 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0799784  normal  0.237967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2083  ferrochelatase  56.7 
 
 
338 aa  359  5e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2754  ferrochelatase  53.71 
 
 
339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.6555  normal  0.146848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3023  ferrochelatase  54.27 
 
 
360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.717829  normal  0.96157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3249  ferrochelatase  54.62 
 
 
343 aa  345  8e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3656  ferrochelatase  53.98 
 
 
340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314821  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2495  ferrochelatase  54.72 
 
 
346 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2503  ferrochelatase  54.4 
 
 
346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2458  ferrochelatase  54.4 
 
 
346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2301  ferrochelatase  51.16 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.198749 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1552  ferrochelatase  50.85 
 
 
380 aa  318  7e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11514  ferrochelatase  52.89 
 
 
344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.20326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2106  ferrochelatase  51.77 
 
 
373 aa  302  8.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1905  ferrochelatase  43.75 
 
 
370 aa  293  3e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1945  ferrochelatase  47.44 
 
 
343 aa  292  8e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1624  ferrochelatase  49.41 
 
 
363 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.220576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1088  ferrochelatase  51.41 
 
 
381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403919  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1407  ferrochelatase  47.7 
 
 
350 aa  288  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.957643  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6777  Ferrochelatase  46.72 
 
 
332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2498  ferrochelatase  47.58 
 
 
341 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2624  Ferrochelatase  45.14 
 
 
381 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2232  ferrochelatase  48.31 
 
 
421 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180991  decreased coverage  0.00658585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2407  Ferrochelatase  49.06 
 
 
393 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333356  hitchhiker  0.00311983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2768  ferrochelatase  42.15 
 
 
426 aa  279  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00310189  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15200  ferrochelatase  43.67 
 
 
449 aa  279  6e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.349388  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2913  ferrochelatase  49.53 
 
 
366 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.02431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2490  ferrochelatase  43.8 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000132256 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26780  ferrochelatase  44.6 
 
 
385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2889  ferrochelatase  46.46 
 
 
339 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00549104  normal  0.445564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1691  ferrochelatase  47.55 
 
 
335 aa  272  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0259091  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1886  Ferrochelatase  45.78 
 
 
383 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08340  ferrochelatase  44.82 
 
 
395 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.145671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1902  ferrochelatase  43.58 
 
 
362 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138282  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15820  ferrochelatase  44.17 
 
 
384 aa  250  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0363986  normal  0.0505419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1545  Ferrochelatase  44.97 
 
 
407 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.494252  normal  0.520149 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1519  Ferrochelatase  39.45 
 
 
338 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2090  ferrochelatase  33.02 
 
 
306 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2029  ferrochelatase  32.7 
 
 
313 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1749  ferrochelatase  32.5 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.665949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2930  ferrochelatase  28.61 
 
 
316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  28.48 
 
 
387 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3547  ferrochelatase  28.84 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1405  ferrochelatase  30.66 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.431534  normal  0.201905 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2991  ferrochelatase  31.33 
 
 
318 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  28.74 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  28.92 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  28.74 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  27.27 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0650  ferrochelatase  26.58 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.540863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1466  ferrochelatase  28.09 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4517  ferrochelatase  29.52 
 
 
387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000264771  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0173  ferrochelatase  27.71 
 
 
319 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2831  predicted protein  26.42 
 
 
366 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00315896  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  27.58 
 
 
388 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2591  ferrochelatase  31.83 
 
 
320 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4133  ferrochelatase  24.76 
 
 
319 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1075  ferrochelatase  23.94 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00091375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1158  ferrochelatase  23.94 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0772321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2715  ferrochelatase  28.45 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0825  ferrochelatase  25.32 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.769229  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05821  ferrochelatase  27.33 
 
 
391 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1000  ferrochelatase  26.27 
 
 
311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1153  ferrochelatase  26.27 
 
 
311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0873  ferrochelatase  25 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000348204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1071  ferrochelatase  26.27 
 
 
311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1208  ferrochelatase  24.76 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156856  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1857  ferrochelatase  27.17 
 
 
391 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.89761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1235  ferrochelatase  23.94 
 
 
319 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0985  ferrochelatase  25.95 
 
 
311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0694  ferrochelatase  29.48 
 
 
303 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2972  ferrochelatase  29.52 
 
 
346 aa  115  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0039  ferrochelatase  26.19 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1311  ferrochelatase  23.64 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000651195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0987  ferrochelatase  25.95 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1231  ferrochelatase  25.63 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  25 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1168  ferrochelatase  25.63 
 
 
311 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1260  ferrochelatase  24.14 
 
 
319 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000115396  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  26.96 
 
 
391 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  26.96 
 
 
391 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45357  predicted protein  28.29 
 
 
509 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0976017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1054  ferrochelatase  23.03 
 
 
319 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000372752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4201  ferrochelatase  25.63 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1886  ferrochelatase  25.71 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0193223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1920  ferrochelatase  25.71 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  26.39 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1104  ferrochelatase  25.32 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0948  ferrochelatase, truncated  26.02 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0647954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1056  ferrochelatase  23.64 
 
 
319 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000187711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0990  ferrochelatase  25.32 
 
 
311 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0845  ferrochelatase  23.89 
 
 
335 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000855481  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  26.32 
 
 
391 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0019  ferrochelatase  28.74 
 
 
317 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1503  ferrochelatase  24.39 
 
 
312 aa  108  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2474  ferrochelatase  28.37 
 
 
362 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0132426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0038  ferrochelatase  25.3 
 
 
317 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0641223 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1367  ferrochelatase  23.69 
 
 
307 aa  106  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.668647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1258  ferrochelatase  29 
 
 
348 aa  106  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>