214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1824 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1824  protein of unknown function UPF0075  100 
 
 
405 aa  770    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.621894  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09600  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  58.27 
 
 
401 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4523  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  56.6 
 
 
384 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00337791  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5656  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  54.45 
 
 
388 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151151  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3511  hypothetical protein  52.56 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0982057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5946  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  53.77 
 
 
374 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25410  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  50.37 
 
 
405 aa  277  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2199  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  52.36 
 
 
395 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2147  protein of unknown function UPF0075  42.64 
 
 
399 aa  245  9e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2256  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.29 
 
 
382 aa  242  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.659425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2293  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.29 
 
 
382 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2465  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.29 
 
 
382 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.450293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2482  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.29 
 
 
382 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0956  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  40.89 
 
 
380 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.153969 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2214  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  33.77 
 
 
382 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2910  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.03 
 
 
382 aa  236  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.648174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1989  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.8 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2561  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  32.98 
 
 
382 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211415  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0470  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.4 
 
 
405 aa  232  7.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2272  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  33.51 
 
 
383 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.325572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2058  protein of unknown function UPF0075  41.78 
 
 
400 aa  230  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1691  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  40.86 
 
 
371 aa  229  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.563729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2420  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  33.51 
 
 
390 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2195  hypothetical protein  41.38 
 
 
365 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2235  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.86 
 
 
384 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2289  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.86 
 
 
384 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.379848  hitchhiker  0.00787899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2498  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  32.46 
 
 
383 aa  225  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156695  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02531  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  39.11 
 
 
379 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1724  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  40.75 
 
 
370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0808287  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00990  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.27 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0878  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  45.04 
 
 
374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.168415  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2585  protein of unknown function UPF0075  40.05 
 
 
359 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0222  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.33 
 
 
370 aa  210  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2071  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  33.33 
 
 
368 aa  209  7e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1728  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.3 
 
 
373 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0419899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1616  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.3 
 
 
373 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.622331  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0848  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.7 
 
 
369 aa  209  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.134258  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1543  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.3 
 
 
373 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.2939  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1556  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.56 
 
 
373 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.671542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2334  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.5 
 
 
392 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1313  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.23 
 
 
369 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1897  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.3 
 
 
373 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.042535  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1008  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.92 
 
 
391 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00596919 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2352  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.77 
 
 
369 aa  207  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0170825  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3060  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.96 
 
 
369 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00819971  hitchhiker  0.00206136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2216  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.47 
 
 
373 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1808  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.01 
 
 
374 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422838  hitchhiker  0.00114252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0909  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  39.31 
 
 
376 aa  206  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1559  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.81 
 
 
369 aa  206  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2315  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.86 
 
 
379 aa  206  8e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.745396  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2557  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.87 
 
 
384 aa  206  8e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0368994  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0993  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.56 
 
 
369 aa  205  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01610  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.81 
 
 
369 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1832  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.81 
 
 
369 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.474183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1878  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.87 
 
 
370 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2664  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.54 
 
 
370 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000349769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2882  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.96 
 
 
369 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018792  hitchhiker  0.000000284725 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1989  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.81 
 
 
369 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01600  hypothetical protein  38.81 
 
 
369 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1770  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.87 
 
 
370 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0871268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1716  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.81 
 
 
369 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.213735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1850  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.54 
 
 
369 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000297882  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2964  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.23 
 
 
369 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00763014  normal  0.0108139 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2000  protein of unknown function UPF0075  38.54 
 
 
369 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000246481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1086  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.63 
 
 
371 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0150902  normal  0.107543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3298  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  33 
 
 
416 aa  203  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00913494 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0123  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  39.11 
 
 
381 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00432099  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1921  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36 
 
 
372 aa  202  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0269  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36 
 
 
372 aa  202  7e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.333083  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02937  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  45.43 
 
 
362 aa  202  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1168  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.23 
 
 
369 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.51487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004408  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.85 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1123  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  33.07 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0140  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.85 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00515473  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3969  hypothetical protein  36.76 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147346  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1126  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.49 
 
 
369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0114032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2973  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.31 
 
 
370 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.128782  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3386  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.56 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3599  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.92 
 
 
413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.284371 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0574  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.76 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3929  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.99 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00335468  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0298  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  41.92 
 
 
378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.590599  normal  0.0104222 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1245  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.68 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141519  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3145  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.96 
 
 
369 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00139586  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2812  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.12 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.122574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1020  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.39 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01577  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1212  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.87 
 
 
369 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0404  protein of unknown function UPF0075  38.9 
 
 
376 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000929624  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2380  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.74 
 
 
370 aa  196  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1354  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.67 
 
 
366 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2407  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  40.53 
 
 
380 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00172923  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1358  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.67 
 
 
366 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0351  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  33.97 
 
 
354 aa  194  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0555  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.12 
 
 
366 aa  192  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10527  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1093  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  39.41 
 
 
378 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0613535  hitchhiker  0.0000150112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5693  protein of unknown function UPF0075  37.15 
 
 
398 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46010  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.87 
 
 
364 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0378  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.24 
 
 
380 aa  189  5e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2643  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  39.57 
 
 
369 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0666841  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00951  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  33.42 
 
 
379 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>