37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0958 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0958  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  806    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0243215  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0555  Protein of unknown function DUF650  57.11 
 
 
397 aa  475  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1830  hypothetical protein  52.03 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1337  hypothetical protein  51.5 
 
 
403 aa  410  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.984704  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0394  hypothetical protein  51.63 
 
 
410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1368  hypothetical protein  49.62 
 
 
395 aa  381  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.642046 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0271  hypothetical protein  49.49 
 
 
402 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1781  hypothetical protein  46.15 
 
 
408 aa  334  2e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0532  hypothetical protein  38.13 
 
 
407 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0199  hypothetical protein  36.79 
 
 
398 aa  248  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2047  hypothetical protein  34.09 
 
 
406 aa  242  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000156756  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1658  hypothetical protein  34.7 
 
 
406 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.487866  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0593  hypothetical protein  34.26 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0243  hypothetical protein  34.26 
 
 
406 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0943  hypothetical protein  39.84 
 
 
418 aa  230  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0326  hypothetical protein  33.42 
 
 
406 aa  226  7e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.25053  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0975  hypothetical protein  33.52 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0226  Protein of unknown function DUF650  33.83 
 
 
396 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0623  hypothetical protein  36.7 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0514  hypothetical protein  31.35 
 
 
431 aa  209  8e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00307015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1571  hypothetical protein  33.86 
 
 
402 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1128  hypothetical protein  34.62 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.157954  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1863  hypothetical protein  32.41 
 
 
382 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2157  hypothetical protein  34.01 
 
 
380 aa  194  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300379  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1859  Protein of unknown function DUF650  33.59 
 
 
408 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0584  hypothetical protein  31.91 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.183239  decreased coverage  0.000387048 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1702  hypothetical protein  32.11 
 
 
399 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.456812  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1972  Protein of unknown function DUF650  33.43 
 
 
426 aa  176  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2780  Protein of unknown function DUF650  28.83 
 
 
390 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0310  Protein of unknown function DUF650  33.61 
 
 
430 aa  173  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.156521 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3192  Protein of unknown function DUF650  34.15 
 
 
427 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.201215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1108  Protein of unknown function DUF650  31.35 
 
 
433 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0317  hypothetical protein  33.24 
 
 
377 aa  162  7e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2606  Protein of unknown function DUF650  32.47 
 
 
433 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1069  hypothetical protein  31.23 
 
 
366 aa  151  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1371  hypothetical protein  52.41 
 
 
164 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0299368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1209  hypothetical protein  30.47 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.7498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>