37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0226 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0226  Protein of unknown function DUF650  100 
 
 
396 aa  812    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2047  hypothetical protein  39.07 
 
 
406 aa  300  4e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000156756  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0532  hypothetical protein  39.17 
 
 
407 aa  292  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0593  hypothetical protein  40.8 
 
 
406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0326  hypothetical protein  41.81 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.25053  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1658  hypothetical protein  41.09 
 
 
406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.487866  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0243  hypothetical protein  40.29 
 
 
406 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0199  hypothetical protein  39.14 
 
 
398 aa  276  6e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0555  Protein of unknown function DUF650  35.71 
 
 
397 aa  242  9e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2780  Protein of unknown function DUF650  35.88 
 
 
390 aa  237  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0514  hypothetical protein  36.53 
 
 
431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00307015  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0975  hypothetical protein  37.33 
 
 
385 aa  233  5e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0943  hypothetical protein  37.31 
 
 
418 aa  229  9e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0394  hypothetical protein  35.01 
 
 
410 aa  226  7e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1337  hypothetical protein  35.5 
 
 
403 aa  225  9e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.984704  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1781  hypothetical protein  34.73 
 
 
408 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1368  hypothetical protein  34.86 
 
 
395 aa  222  9e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.642046 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0584  hypothetical protein  35.03 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.183239  decreased coverage  0.000387048 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0958  hypothetical protein  33.83 
 
 
399 aa  218  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0243215  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1972  Protein of unknown function DUF650  35.98 
 
 
426 aa  216  8e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177811  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0310  Protein of unknown function DUF650  33.25 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.156521 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3192  Protein of unknown function DUF650  32.64 
 
 
427 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.201215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1863  hypothetical protein  33.5 
 
 
382 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2157  hypothetical protein  34.27 
 
 
380 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300379  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1128  hypothetical protein  35.88 
 
 
404 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.157954  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1108  Protein of unknown function DUF650  34.6 
 
 
433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1830  hypothetical protein  36.13 
 
 
406 aa  193  5e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1702  hypothetical protein  31.42 
 
 
399 aa  191  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.456812  normal  0.715012 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1859  Protein of unknown function DUF650  33.42 
 
 
408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0271  hypothetical protein  34.41 
 
 
402 aa  187  4e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0623  hypothetical protein  33.24 
 
 
410 aa  186  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2606  Protein of unknown function DUF650  33.14 
 
 
433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1069  hypothetical protein  32.95 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0317  hypothetical protein  31.93 
 
 
377 aa  164  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1571  hypothetical protein  32.88 
 
 
402 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1209  hypothetical protein  30.25 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.7498 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1371  hypothetical protein  29.86 
 
 
164 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0299368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>