37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1702 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1702  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  811    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.456812  normal  0.715012 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1859  Protein of unknown function DUF650  53.12 
 
 
408 aa  444  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1128  hypothetical protein  46.67 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.157954  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0943  hypothetical protein  37.62 
 
 
418 aa  271  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2047  hypothetical protein  39.12 
 
 
406 aa  266  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000156756  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0593  hypothetical protein  37.19 
 
 
406 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0243  hypothetical protein  37.04 
 
 
406 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0532  hypothetical protein  37.41 
 
 
407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0326  hypothetical protein  36.27 
 
 
406 aa  252  7e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.25053  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1209  hypothetical protein  42.29 
 
 
378 aa  252  1e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.7498 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1658  hypothetical protein  36.7 
 
 
406 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.487866  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1069  hypothetical protein  41.52 
 
 
366 aa  246  4e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0317  hypothetical protein  42.98 
 
 
377 aa  243  6e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0199  hypothetical protein  36.88 
 
 
398 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0514  hypothetical protein  33.67 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00307015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1781  hypothetical protein  33.09 
 
 
408 aa  206  6e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1863  hypothetical protein  32.58 
 
 
382 aa  202  9e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0584  hypothetical protein  34 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.183239  decreased coverage  0.000387048 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2780  Protein of unknown function DUF650  33.92 
 
 
390 aa  199  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0394  hypothetical protein  35 
 
 
410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1337  hypothetical protein  35 
 
 
403 aa  192  8e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.984704  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0226  Protein of unknown function DUF650  31.42 
 
 
396 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0555  Protein of unknown function DUF650  31.62 
 
 
397 aa  191  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1972  Protein of unknown function DUF650  34.46 
 
 
426 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177811  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1368  hypothetical protein  34.2 
 
 
395 aa  186  6e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.642046 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0975  hypothetical protein  30.3 
 
 
385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3192  Protein of unknown function DUF650  34.46 
 
 
427 aa  183  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.201215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2157  hypothetical protein  31.49 
 
 
380 aa  182  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300379  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0958  hypothetical protein  32.11 
 
 
399 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0243215  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0310  Protein of unknown function DUF650  32.73 
 
 
430 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.156521 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1830  hypothetical protein  34.55 
 
 
406 aa  177  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1108  Protein of unknown function DUF650  32.87 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0271  hypothetical protein  35.22 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2606  Protein of unknown function DUF650  32.35 
 
 
433 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0623  hypothetical protein  30.68 
 
 
410 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1571  hypothetical protein  30.39 
 
 
402 aa  147  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1371  hypothetical protein  34.13 
 
 
164 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0299368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>