37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0317 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0317  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  748    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1209  hypothetical protein  76.13 
 
 
378 aa  570  1e-161  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.7498 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1069  hypothetical protein  69.67 
 
 
366 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1128  hypothetical protein  43.59 
 
 
404 aa  257  3e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.157954  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1702  hypothetical protein  42.98 
 
 
399 aa  243  5e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.456812  normal  0.715012 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1859  Protein of unknown function DUF650  39.38 
 
 
408 aa  234  3e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0943  hypothetical protein  41.36 
 
 
418 aa  208  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0243  hypothetical protein  34.76 
 
 
406 aa  205  9e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0593  hypothetical protein  34.47 
 
 
406 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1658  hypothetical protein  33.9 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.487866  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0326  hypothetical protein  33.05 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.25053  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0532  hypothetical protein  33.08 
 
 
407 aa  193  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1368  hypothetical protein  39.35 
 
 
395 aa  190  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.642046 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1781  hypothetical protein  35.05 
 
 
408 aa  186  7e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0394  hypothetical protein  36.13 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1337  hypothetical protein  37.05 
 
 
403 aa  182  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.984704  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2047  hypothetical protein  32.3 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000156756  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0555  Protein of unknown function DUF650  31.93 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1830  hypothetical protein  33.95 
 
 
406 aa  173  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0514  hypothetical protein  30.18 
 
 
431 aa  169  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00307015  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0226  Protein of unknown function DUF650  31.93 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2780  Protein of unknown function DUF650  33.15 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0958  hypothetical protein  33.24 
 
 
399 aa  162  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0243215  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0199  hypothetical protein  34.26 
 
 
398 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1972  Protein of unknown function DUF650  32.93 
 
 
426 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177811  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3192  Protein of unknown function DUF650  32.63 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.201215 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0584  hypothetical protein  32.32 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.183239  decreased coverage  0.000387048 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0271  hypothetical protein  36.49 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1863  hypothetical protein  30.92 
 
 
382 aa  146  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2157  hypothetical protein  31.64 
 
 
380 aa  143  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300379  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0975  hypothetical protein  31.21 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0310  Protein of unknown function DUF650  33.53 
 
 
430 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.156521 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1108  Protein of unknown function DUF650  32.02 
 
 
433 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2606  Protein of unknown function DUF650  31.4 
 
 
433 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0623  hypothetical protein  28.83 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1571  hypothetical protein  30.58 
 
 
402 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1371  hypothetical protein  36.3 
 
 
164 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0299368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>