13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2697 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2697  O-antigen polymerase  100 
 
 		 406 aa  741    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0361626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2256  O-antigen polymerase  59.2 
 
 		 409 aa  319  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.04422  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2300  O-antigen polymerase  60.59 
 
 		 428 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00840255  hitchhiker  0.00785546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2575  O-antigen polymerase  61.13 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4667  O-antigen polymerase  53.8 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4779  O-antigen polymerase  54.57 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24915  normal  0.386809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  28.81 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  28.81 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3543  O-antigen polymerase  32.58 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4808  O-antigen polymerase  29.04 
 
 		 391 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2392  O-antigen polymerase  24.92 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575587  normal  0.815053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  26.88 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2114  O-antigen polymerase  27.68 
 
 		 424 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0926963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>