9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2114 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2114  O-antigen polymerase  100 
 
 		 424 aa  803    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0926963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3543  O-antigen polymerase  28.7 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2392  O-antigen polymerase  26.5 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575587  normal  0.815053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2618  hypothetical protein  28.02 
 
 		 410 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.0251098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2300  O-antigen polymerase  31.11 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00840255  hitchhiker  0.00785546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  28.49 
 
 		 506 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2575  O-antigen polymerase  31.56 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2339  hypothetical protein  27.35 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  30.59 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>