24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3251 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3251  protein of unknown function DUF433  100 
 
 
214 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3472  hypothetical protein  51.89 
 
 
217 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.84444 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4858  hypothetical protein  30.54 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332293  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5509  protein of unknown function DUF433  32 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0404309 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5918  protein of unknown function DUF433  32.32 
 
 
125 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1682  hypothetical protein  44.07 
 
 
76 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00134112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2207  protein of unknown function DUF433  37.1 
 
 
86 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000283709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2019  hypothetical protein  46.3 
 
 
216 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0813587  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4961  hypothetical protein  43.33 
 
 
76 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0170  protein of unknown function DUF433  31.25 
 
 
94 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2182  protein of unknown function DUF433  42.11 
 
 
80 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0840414  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0280  protein of unknown function DUF433  45.83 
 
 
80 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.850652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0082  hypothetical protein  39.06 
 
 
76 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.024664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0695  hypothetical protein  46.3 
 
 
88 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.173069  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1888  protein of unknown function DUF433  38.1 
 
 
74 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3849  protein of unknown function DUF433  46.3 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0165  protein of unknown function DUF433  36.07 
 
 
95 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1913  protein of unknown function DUF433  38.1 
 
 
74 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0274585  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2516  protein of unknown function DUF433  38.6 
 
 
82 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0559942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  35.38 
 
 
127 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2261  hypothetical protein  38.33 
 
 
84 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000450258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  47.83 
 
 
217 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0674  hypothetical protein  37.1 
 
 
105 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490782  normal  0.33948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2498  hypothetical protein  31.37 
 
 
72 aa  41.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.799873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>