41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0217 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0217  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  577  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.745262 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0212  hypothetical protein  41.13 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2836  hypothetical protein  34.15 
 
 
220 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000263476  hitchhiker  0.0000925306 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  37.8 
 
 
136 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  37.8 
 
 
136 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  37.8 
 
 
136 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  37.8 
 
 
136 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  37.8 
 
 
136 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  37.8 
 
 
136 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  36.67 
 
 
122 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  46.3 
 
 
121 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  52.38 
 
 
122 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 
122 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  42.86 
 
 
154 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 
121 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 
122 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0049  hypothetical protein  28.97 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  42.86 
 
 
225 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  42.86 
 
 
225 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  42.86 
 
 
225 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  42.86 
 
 
225 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  42.86 
 
 
225 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  42.86 
 
 
225 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  41.1 
 
 
133 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  41.1 
 
 
133 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  51.16 
 
 
135 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4959  hypothetical protein  52.5 
 
 
298 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00383302  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
133 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>