49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1744 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1744  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
401 aa  818    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.153739  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0838  S-adenosylmethionine synthetase  69.17 
 
 
400 aa  590  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.318063  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1064  S-adenosylmethionine synthetase  69.1 
 
 
400 aa  589  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329658  normal  0.097531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0923  S-adenosylmethionine synthetase  65.5 
 
 
400 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.878507  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0490  S-adenosylmethionine synthetase  62.28 
 
 
405 aa  529  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.706606  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1313  S-adenosylmethionine synthetase  61.15 
 
 
398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1330  S-adenosylmethionine synthetase  58.85 
 
 
401 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0754836  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3461  Methionine adenosyltransferase  55.61 
 
 
401 aa  465  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0513  S-adenosylmethionine synthetase  56.36 
 
 
400 aa  449  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1394  S-adenosylmethionine synthetase  55.03 
 
 
400 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2306  Methionine adenosyltransferase  53.87 
 
 
400 aa  451  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.01761  normal  0.685937 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0726  S-adenosylmethionine synthetase  54.39 
 
 
399 aa  444  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0318344  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1669  Methionine adenosyltransferase  52.37 
 
 
401 aa  426  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0945  S-adenosylmethionine synthetase  51.6 
 
 
404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.939841  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0913  S-adenosylmethionine synthetase  51.6 
 
 
405 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  0.830566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1768  S-adenosylmethionine synthetase  51.6 
 
 
405 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1293  Methionine adenosyltransferase  48.5 
 
 
398 aa  404  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0691116  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1031  S-adenosylmethionine synthetase  50.86 
 
 
405 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0461  S-adenosylmethionine synthetase  51.11 
 
 
403 aa  395  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0865  S-adenosylmethionine synthetase  44.96 
 
 
408 aa  350  2e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0745  S-adenosylmethionine synthetase  48.44 
 
 
399 aa  342  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257427  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0737  S-adenosylmethionine synthetase  42.54 
 
 
406 aa  334  1e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0136402  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0921  S-adenosylmethionine synthetase  42.33 
 
 
404 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0689  S-adenosylmethionine synthetase  44.25 
 
 
460 aa  331  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.918413 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2333  S-adenosylmethionine synthetase  41.44 
 
 
403 aa  330  3e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.030297  hitchhiker  0.00106095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0746  S-adenosylmethionine synthetase  45.24 
 
 
404 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1975  S-adenosylmethionine synthetase  42.04 
 
 
402 aa  329  4e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0691  S-adenosylmethionine synthetase  40.3 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.234507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1180  Methionine adenosyltransferase  41.34 
 
 
404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0497405  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1822  S-adenosylmethionine synthetase  44 
 
 
404 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2103  S-adenosylmethionine synthetase  43.03 
 
 
402 aa  324  2e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0095  S-adenosylmethionine synthetase  42.25 
 
 
400 aa  322  9.000000000000001e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000589385  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0231  S-adenosylmethionine synthetase  39.6 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00947715 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0510  S-adenosylmethionine synthetase  38.9 
 
 
401 aa  297  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2839  S-adenosylmethionine synthetase  38.54 
 
 
400 aa  297  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0186  S-adenosylmethionine synthetase  39.9 
 
 
400 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0551  S-adenosylmethionine synthetase  40.83 
 
 
404 aa  292  9e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.919029  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1448  S-adenosylmethionine synthetase  39.29 
 
 
403 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1862  S-adenosylmethionine synthetase  37.5 
 
 
410 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.238805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0918  S-adenosylmethionine synthetase  38.34 
 
 
400 aa  275  8e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0247995  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6197  S-adenosylmethionine synthetase  41.03 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1403  S-adenosylmethionine synthetase  38.08 
 
 
364 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3284  S-adenosylmethionine synthetase  40.57 
 
 
401 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0965  S-adenosylmethionine synthetase  40.11 
 
 
401 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.795652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2549  S-adenosylmethionine synthetase  36.69 
 
 
400 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000819809  hitchhiker  0.00000000000000187217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1694  S-adenosylmethionine synthetase  37.18 
 
 
394 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5306  S-adenosylmethionine synthetase  37.18 
 
 
394 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1136  S-adenosylmethionine synthetase  28.25 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208994  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3663  S-adenosylmethionine synthetase-like protein  40.74 
 
 
96 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0172337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>