49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1136 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1136  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 408 aa  822    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0461  S-adenosylmethionine synthetase  32.51 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0913  S-adenosylmethionine synthetase  32.51 
 
 		 405 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  0.830566 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1031  S-adenosylmethionine synthetase  32.51 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1394  S-adenosylmethionine synthetase  33.69 
 
 		 400 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1768  S-adenosylmethionine synthetase  32.24 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3461  Methionine adenosyltransferase  32.54 
 
 		 401 aa  169  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0945  S-adenosylmethionine synthetase  31.42 
 
 		 404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.939841  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1330  S-adenosylmethionine synthetase  30.2 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0754836  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2306  Methionine adenosyltransferase  32.48 
 
 		 400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.01761  normal  0.685937 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0865  S-adenosylmethionine synthetase  30.56 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1669  Methionine adenosyltransferase  31.59 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0923  S-adenosylmethionine synthetase  30.59 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.878507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2839  S-adenosylmethionine synthetase  33.52 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1822  S-adenosylmethionine synthetase  31.61 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3284  S-adenosylmethionine synthetase  33.33 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1313  S-adenosylmethionine synthetase  26.97 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1064  S-adenosylmethionine synthetase  31.05 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329658  normal  0.097531 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0095  S-adenosylmethionine synthetase  33.23 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000589385  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0737  S-adenosylmethionine synthetase  32.41 
 
 		 406 aa  153  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0136402  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0510  S-adenosylmethionine synthetase  31.35 
 
 		 401 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0838  S-adenosylmethionine synthetase  31.14 
 
 		 400 aa  152  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.318063  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0689  S-adenosylmethionine synthetase  28.89 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.918413 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1180  Methionine adenosyltransferase  28.57 
 
 		 404 aa  152  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0497405  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1293  Methionine adenosyltransferase  29.35 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0691116  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0726  S-adenosylmethionine synthetase  30.5 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0318344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0231  S-adenosylmethionine synthetase  29.95 
 
 		 405 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00947715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0918  S-adenosylmethionine synthetase  33.52 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0247995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0965  S-adenosylmethionine synthetase  33.05 
 
 		 401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.795652 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0513  S-adenosylmethionine synthetase  30.91 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0921  S-adenosylmethionine synthetase  28.32 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2549  S-adenosylmethionine synthetase  31.9 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000819809  hitchhiker  0.00000000000000187217 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0186  S-adenosylmethionine synthetase  32.95 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0745  S-adenosylmethionine synthetase  29.25 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0746  S-adenosylmethionine synthetase  29.97 
 
 		 404 aa  142  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2333  S-adenosylmethionine synthetase  29.29 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.030297  hitchhiker  0.00106095 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1975  S-adenosylmethionine synthetase  28.61 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2103  S-adenosylmethionine synthetase  32.09 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0551  S-adenosylmethionine synthetase  32.61 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.919029  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0691  S-adenosylmethionine synthetase  27.46 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.234507 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0490  S-adenosylmethionine synthetase  28.78 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.706606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1448  S-adenosylmethionine synthetase  32.46 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1403  S-adenosylmethionine synthetase  30.87 
 
 		 364 aa  130  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1744  S-adenosylmethionine synthetase  28.25 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.153739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6197  S-adenosylmethionine synthetase  31.3 
 
 		 394 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1862  S-adenosylmethionine synthetase  28.61 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238805 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5306  S-adenosylmethionine synthetase  31.64 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1694  S-adenosylmethionine synthetase  31.64 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3663  S-adenosylmethionine synthetase-like protein  54.9 
 
 		 96 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0172337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>