49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3284 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3284  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 401 aa  821    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0965  S-adenosylmethionine synthetase  95.26 
 
 		 401 aa  738    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.795652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1448  S-adenosylmethionine synthetase  69.25 
 
 		 403 aa  568  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2839  S-adenosylmethionine synthetase  67.33 
 
 		 400 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2549  S-adenosylmethionine synthetase  66.83 
 
 		 400 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000819809  hitchhiker  0.00000000000000187217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0918  S-adenosylmethionine synthetase  64.93 
 
 		 400 aa  528  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0247995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0186  S-adenosylmethionine synthetase  56.25 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0921  S-adenosylmethionine synthetase  54.75 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1862  S-adenosylmethionine synthetase  54.52 
 
 		 410 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238805 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0689  S-adenosylmethionine synthetase  49.12 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.918413 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0551  S-adenosylmethionine synthetase  50.88 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.919029  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0746  S-adenosylmethionine synthetase  50.51 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1822  S-adenosylmethionine synthetase  48.5 
 
 		 404 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0510  S-adenosylmethionine synthetase  50.38 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0737  S-adenosylmethionine synthetase  44.94 
 
 		 406 aa  322  7e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0136402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2306  Methionine adenosyltransferase  44.05 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.01761  normal  0.685937 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0865  S-adenosylmethionine synthetase  41.34 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0726  S-adenosylmethionine synthetase  42.64 
 
 		 399 aa  300  4e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0318344  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0691  S-adenosylmethionine synthetase  39.4 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.234507 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1394  S-adenosylmethionine synthetase  42.49 
 
 		 400 aa  299  6e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1975  S-adenosylmethionine synthetase  40.15 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1180  Methionine adenosyltransferase  39.58 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0497405  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1330  S-adenosylmethionine synthetase  39.59 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0754836  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0095  S-adenosylmethionine synthetase  43.06 
 
 		 400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000589385  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0745  S-adenosylmethionine synthetase  38.97 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257427  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2333  S-adenosylmethionine synthetase  38.85 
 
 		 403 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.030297  hitchhiker  0.00106095 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0513  S-adenosylmethionine synthetase  41.49 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1313  S-adenosylmethionine synthetase  39.75 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3461  Methionine adenosyltransferase  41.16 
 
 		 401 aa  279  8e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2103  S-adenosylmethionine synthetase  38.96 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1744  S-adenosylmethionine synthetase  37.92 
 
 		 401 aa  273  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.153739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0231  S-adenosylmethionine synthetase  37.92 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00947715 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0461  S-adenosylmethionine synthetase  38.36 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1669  Methionine adenosyltransferase  40.74 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0923  S-adenosylmethionine synthetase  35.79 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.878507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1293  Methionine adenosyltransferase  37.94 
 
 		 398 aa  266  5.999999999999999e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0691116  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1064  S-adenosylmethionine synthetase  37.5 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329658  normal  0.097531 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0945  S-adenosylmethionine synthetase  37.44 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.939841  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0838  S-adenosylmethionine synthetase  37.9 
 
 		 400 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.318063  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1031  S-adenosylmethionine synthetase  36.7 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0913  S-adenosylmethionine synthetase  36.7 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  0.830566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1768  S-adenosylmethionine synthetase  36.45 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0490  S-adenosylmethionine synthetase  37.63 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.706606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6197  S-adenosylmethionine synthetase  39.64 
 
 		 394 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1694  S-adenosylmethionine synthetase  38.87 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5306  S-adenosylmethionine synthetase  38.87 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1403  S-adenosylmethionine synthetase  38.46 
 
 		 364 aa  204  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1136  S-adenosylmethionine synthetase  33.33 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3663  S-adenosylmethionine synthetase-like protein  38.1 
 
 		 96 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0172337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>