48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1694 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5306  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 394 aa  788    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1694  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 394 aa  788    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6197  S-adenosylmethionine synthetase  64.47 
 
 		 394 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0737  S-adenosylmethionine synthetase  42.49 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0136402  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0095  S-adenosylmethionine synthetase  42.3 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000589385  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2306  Methionine adenosyltransferase  38.56 
 
 		 400 aa  275  7e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.01761  normal  0.685937 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0461  S-adenosylmethionine synthetase  38.75 
 
 		 403 aa  275  9e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3461  Methionine adenosyltransferase  38.46 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1394  S-adenosylmethionine synthetase  38.68 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1293  Methionine adenosyltransferase  39.55 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0691116  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0913  S-adenosylmethionine synthetase  37.75 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  0.830566 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0745  S-adenosylmethionine synthetase  37.15 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257427  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1031  S-adenosylmethionine synthetase  37.75 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0510  S-adenosylmethionine synthetase  41.42 
 
 		 401 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1768  S-adenosylmethionine synthetase  37.25 
 
 		 405 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0945  S-adenosylmethionine synthetase  36.75 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.939841  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1975  S-adenosylmethionine synthetase  38.38 
 
 		 402 aa  263  3e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1669  Methionine adenosyltransferase  39.01 
 
 		 401 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0865  S-adenosylmethionine synthetase  38.1 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0513  S-adenosylmethionine synthetase  38.89 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1862  S-adenosylmethionine synthetase  38.46 
 
 		 410 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238805 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0691  S-adenosylmethionine synthetase  37.95 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.234507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2333  S-adenosylmethionine synthetase  37.53 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.030297  hitchhiker  0.00106095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0921  S-adenosylmethionine synthetase  37.75 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0551  S-adenosylmethionine synthetase  40.49 
 
 		 404 aa  260  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.919029  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2549  S-adenosylmethionine synthetase  39.41 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000819809  hitchhiker  0.00000000000000187217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1313  S-adenosylmethionine synthetase  37.89 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1822  S-adenosylmethionine synthetase  38.77 
 
 		 404 aa  256  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1064  S-adenosylmethionine synthetase  36.67 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329658  normal  0.097531 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1180  Methionine adenosyltransferase  35.96 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0497405  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2103  S-adenosylmethionine synthetase  37.89 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2839  S-adenosylmethionine synthetase  39.44 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0923  S-adenosylmethionine synthetase  36.41 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.878507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1744  S-adenosylmethionine synthetase  37.18 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.153739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0838  S-adenosylmethionine synthetase  36.15 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.318063  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0689  S-adenosylmethionine synthetase  36.61 
 
 		 460 aa  250  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.918413 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0231  S-adenosylmethionine synthetase  35.14 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00947715 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0746  S-adenosylmethionine synthetase  39.39 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0726  S-adenosylmethionine synthetase  38.1 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0318344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0918  S-adenosylmethionine synthetase  40.63 
 
 		 400 aa  245  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0247995  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1330  S-adenosylmethionine synthetase  39.18 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0754836  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1403  S-adenosylmethionine synthetase  39.79 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0490  S-adenosylmethionine synthetase  34.99 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.706606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0186  S-adenosylmethionine synthetase  40.52 
 
 		 400 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1448  S-adenosylmethionine synthetase  37.59 
 
 		 403 aa  236  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3284  S-adenosylmethionine synthetase  40 
 
 		 401 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0965  S-adenosylmethionine synthetase  39.88 
 
 		 401 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.795652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1136  S-adenosylmethionine synthetase  31.64 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>