49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0551 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0551  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
404 aa  823    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.919029  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0746  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 
404 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0689  S-adenosylmethionine synthetase  57.18 
 
 
460 aa  496  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.918413 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0510  S-adenosylmethionine synthetase  60.8 
 
 
401 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1822  S-adenosylmethionine synthetase  57.43 
 
 
404 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0921  S-adenosylmethionine synthetase  51.99 
 
 
404 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2839  S-adenosylmethionine synthetase  52.63 
 
 
400 aa  408  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1448  S-adenosylmethionine synthetase  52 
 
 
403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1862  S-adenosylmethionine synthetase  49.88 
 
 
410 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.238805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0186  S-adenosylmethionine synthetase  51.3 
 
 
400 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2549  S-adenosylmethionine synthetase  50.75 
 
 
400 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000819809  hitchhiker  0.00000000000000187217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0918  S-adenosylmethionine synthetase  51 
 
 
400 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0247995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3284  S-adenosylmethionine synthetase  50.88 
 
 
401 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0965  S-adenosylmethionine synthetase  50.88 
 
 
401 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.795652 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0865  S-adenosylmethionine synthetase  43.78 
 
 
408 aa  327  3e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0737  S-adenosylmethionine synthetase  47.78 
 
 
406 aa  319  5e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0136402  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0095  S-adenosylmethionine synthetase  43.64 
 
 
400 aa  316  4e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000589385  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2333  S-adenosylmethionine synthetase  42.75 
 
 
403 aa  310  2e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.030297  hitchhiker  0.00106095 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1975  S-adenosylmethionine synthetase  43.5 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0691  S-adenosylmethionine synthetase  41.75 
 
 
402 aa  308  9e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.234507 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0745  S-adenosylmethionine synthetase  42.89 
 
 
399 aa  303  5.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257427  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1293  Methionine adenosyltransferase  43.25 
 
 
398 aa  301  1e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0691116  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1394  S-adenosylmethionine synthetase  41.6 
 
 
400 aa  300  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2306  Methionine adenosyltransferase  41.97 
 
 
400 aa  298  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.01761  normal  0.685937 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2103  S-adenosylmethionine synthetase  44.14 
 
 
402 aa  297  3e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1180  Methionine adenosyltransferase  41.35 
 
 
404 aa  293  4e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0497405  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1744  S-adenosylmethionine synthetase  40.83 
 
 
401 aa  292  9e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.153739  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0945  S-adenosylmethionine synthetase  40.29 
 
 
404 aa  292  9e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.939841  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0231  S-adenosylmethionine synthetase  41.5 
 
 
405 aa  291  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00947715 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0726  S-adenosylmethionine synthetase  44.51 
 
 
399 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0318344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1064  S-adenosylmethionine synthetase  39.02 
 
 
400 aa  288  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329658  normal  0.097531 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3461  Methionine adenosyltransferase  41.09 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0461  S-adenosylmethionine synthetase  39.95 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1313  S-adenosylmethionine synthetase  39.29 
 
 
398 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0838  S-adenosylmethionine synthetase  39.38 
 
 
400 aa  280  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.318063  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0513  S-adenosylmethionine synthetase  40.11 
 
 
400 aa  280  5e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1768  S-adenosylmethionine synthetase  38.48 
 
 
405 aa  279  5e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0913  S-adenosylmethionine synthetase  38.97 
 
 
405 aa  279  7e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  0.830566 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1031  S-adenosylmethionine synthetase  38.24 
 
 
405 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1330  S-adenosylmethionine synthetase  38.29 
 
 
401 aa  276  5e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0754836  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6197  S-adenosylmethionine synthetase  44.13 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0923  S-adenosylmethionine synthetase  35.59 
 
 
400 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.878507  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1669  Methionine adenosyltransferase  39.9 
 
 
401 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0490  S-adenosylmethionine synthetase  37.4 
 
 
405 aa  261  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.706606  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5306  S-adenosylmethionine synthetase  40.49 
 
 
394 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1694  S-adenosylmethionine synthetase  40.49 
 
 
394 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1403  S-adenosylmethionine synthetase  39.79 
 
 
364 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1136  S-adenosylmethionine synthetase  32.61 
 
 
408 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208994  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3663  S-adenosylmethionine synthetase-like protein  38.33 
 
 
96 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0172337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>