19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0115 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0115  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  481  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2066  hypothetical protein  46.43 
 
 
240 aa  231  7.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0787  hypothetical protein  33.77 
 
 
234 aa  165  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00145618  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3748  hypothetical protein  34.2 
 
 
207 aa  111  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1761  hypothetical protein  35.38 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.777883  normal  0.0195749 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1420  hypothetical protein  26.07 
 
 
233 aa  108  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.497473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1015  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2005  hypothetical protein  33.51 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.035973 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1424  hypothetical protein  29.28 
 
 
217 aa  89.7  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2886  hypothetical protein  27.88 
 
 
228 aa  82  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1686  hypothetical protein  27.63 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.78966  normal  0.629648 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2349  hypothetical protein  26.58 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2546  hypothetical protein  26.7 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0401409  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2775  hypothetical protein  22.49 
 
 
501 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182436  normal  0.989324 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2258  hypothetical protein  26.53 
 
 
202 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0144555 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3138  hypothetical protein  32.73 
 
 
287 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1714  hypothetical protein  27.98 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0309  hypothetical protein  24.73 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1621  hypothetical protein  21.79 
 
 
194 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0377801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>