17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2258 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2258  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  410  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0144555 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2886  hypothetical protein  35.61 
 
 
228 aa  121  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1761  hypothetical protein  35.75 
 
 
200 aa  107  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.777883  normal  0.0195749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1015  hypothetical protein  32.32 
 
 
210 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2546  hypothetical protein  32.67 
 
 
228 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0401409  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3748  hypothetical protein  32.29 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1420  hypothetical protein  28.91 
 
 
233 aa  94  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.497473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2005  hypothetical protein  34.09 
 
 
227 aa  91.7  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.035973 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2066  hypothetical protein  32.37 
 
 
240 aa  84.7  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2349  hypothetical protein  32.7 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1686  hypothetical protein  30.69 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.78966  normal  0.629648 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1424  hypothetical protein  32.47 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0787  hypothetical protein  25.23 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00145618  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2775  hypothetical protein  28.14 
 
 
501 aa  58.2  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182436  normal  0.989324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0115  hypothetical protein  26.53 
 
 
237 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0407  hypothetical protein  28.97 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00939806  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0645  hypothetical protein  30.49 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>