15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0407 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0407  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00939806  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1621  hypothetical protein  45.81 
 
 
194 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0377801 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0032  hypothetical protein  26.8 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1015  hypothetical protein  26.47 
 
 
210 aa  61.6  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3748  hypothetical protein  27.01 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0715  hypothetical protein  26.17 
 
 
191 aa  52.4  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.39433  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2546  hypothetical protein  26.17 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0401409  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1761  hypothetical protein  23.65 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.777883  normal  0.0195749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0787  hypothetical protein  30.43 
 
 
234 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00145618  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2066  hypothetical protein  26.38 
 
 
240 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0309  hypothetical protein  29.23 
 
 
234 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1420  hypothetical protein  25.42 
 
 
233 aa  45.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.497473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2005  hypothetical protein  23.17 
 
 
227 aa  45.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.035973 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2258  hypothetical protein  28.97 
 
 
202 aa  44.7  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0144555 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2886  hypothetical protein  31.88 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>