36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3138 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3138  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  583  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4921  hypothetical protein  39.42 
 
 
278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0309  hypothetical protein  38.58 
 
 
234 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0645  hypothetical protein  31.05 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1042  hypothetical protein  42.86 
 
 
186 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.098896  normal  0.106595 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1761  hypothetical protein  41.94 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.777883  normal  0.0195749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1015  hypothetical protein  40.86 
 
 
210 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0172  hypothetical protein  30.65 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1420  hypothetical protein  36 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.497473  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3748  hypothetical protein  36.63 
 
 
207 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2886  hypothetical protein  33.68 
 
 
228 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0787  hypothetical protein  24.35 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00145618  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2546  hypothetical protein  34.38 
 
 
228 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0401409  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1714  hypothetical protein  37.78 
 
 
218 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2349  hypothetical protein  34 
 
 
229 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1686  hypothetical protein  31.68 
 
 
227 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.78966  normal  0.629648 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2066  hypothetical protein  26.37 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1424  hypothetical protein  34.31 
 
 
217 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0115  hypothetical protein  32.73 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2005  hypothetical protein  30.56 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.035973 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1130  hypothetical protein  39.71 
 
 
192 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.374886  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2025  hypothetical protein  44.78 
 
 
100 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349188  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0364  hypothetical protein  33 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0044  hypothetical protein  43.06 
 
 
98 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3152  hypothetical protein  40.58 
 
 
82 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.34063  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1335  hypothetical protein  40.24 
 
 
85 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.447415  normal  0.712586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0149  hypothetical protein  38.03 
 
 
85 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4073  hypothetical protein  39.71 
 
 
98 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3490  hypothetical protein  37.84 
 
 
104 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2129  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2130  hypothetical protein  38.03 
 
 
93 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0161  hypothetical protein  40.58 
 
 
105 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3713  hypothetical protein  28.79 
 
 
118 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0718  hypothetical protein  40.85 
 
 
118 aa  42.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3378  hypothetical protein  44 
 
 
100 aa  42.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1034  hypothetical protein  34.85 
 
 
108 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.205289  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>