19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7555 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7555  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  494  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  74.36 
 
 		 272 aa  361  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1833  hypothetical protein  48.02 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1554  hypothetical protein  48.02 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1687  hypothetical protein  43.95 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1481  hypothetical protein  48.17 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000170904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2258  hypothetical protein  30 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  32.72 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  33.82 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2072  protein of unknown function DUF883 ElaB  39.51 
 
 		 170 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  32.56 
 
 		 407 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  29.95 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  34.17 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  29.27 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  27.85 
 
 		 329 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01430  hypothetical protein  31.94 
 
 		 232 aa  45.4  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  28.16 
 
 		 405 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  32.5 
 
 		 125 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  26.81 
 
 		 250 aa  42  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>