23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1833 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1833  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  550  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1554  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  550  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1687  hypothetical protein  81.23 
 
 		 263 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  47.53 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1481  hypothetical protein  51.59 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000170904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7555  hypothetical protein  47.76 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2258  hypothetical protein  36.08 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  32.33 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  32.52 
 
 		 407 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  27.51 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  30.89 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  34.64 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0560  hypothetical protein  28.19 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0050  hypothetical protein  28.19 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  34.64 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  33.55 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  27.07 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2072  protein of unknown function DUF883 ElaB  27.69 
 
 		 170 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01430  hypothetical protein  31.45 
 
 		 232 aa  46.2  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  34.62 
 
 		 405 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  32.6 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  25.56 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  26.55 
 
 		 250 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>