12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5018 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5018    100 
 
 		 120 bp  238  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  96.88 
 
 		 1032 bp  56  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.11 
 
 		 1011 bp  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  93.75 
 
 		 1029 bp  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  93.75 
 
 		 1029 bp  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  93.75 
 
 		 1029 bp  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  93.75 
 
 		 1029 bp  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  93.75 
 
 		 1029 bp  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4502    91.43 
 
 		 276 bp  46.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2539  hypothetical protein  100 
 
 		 858 bp  46.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  96.3 
 
 		 1902 bp  46.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6580  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.47 
 
 		 1026 bp  44.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0128065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>