91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3351 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3351  phenylacetic acid catabolic family protein  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0933  phenylacetic acid catabolic  67.07 
 
 		 250 aa  346  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4805  phenylacetic acid catabolic family protein  67.89 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0787  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  26.53 
 
 		 334 aa  72  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1027  phenylacetic acid catabolic family protein  24.03 
 
 		 314 aa  68.6  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.144453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1763  phenylacetic acid catabolic family protein  25.96 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0354144  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2888  phenylacetic acid catabolic family protein  23.61 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0295  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.81 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3765  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.561951  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3662  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.28 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447382  hitchhiker  0.000000402126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2857  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.35 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134778  hitchhiker  0.00443888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1543  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaG subunit  25.82 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3278  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.68 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5827  phenylacetic acid catabolic family protein  25.44 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243582  normal  0.499001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2481  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.68 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2410  phenylacetate-CoA oxygenase PaaG  23.81 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2631  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.26 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.457511  normal  0.0608479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2618  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.83 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.456991 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0232  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.61 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000140715  hitchhiker  0.00153868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3095  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.95 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00851202  hitchhiker  0.000883157 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0807  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  27.44 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4172  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05335  phenylacetic acid degradation protein  23.89 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00573911  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0249  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.61 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00347224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0650  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  25.23 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2865  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.41 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0446209  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3045  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaG subunit  23.38 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3495  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.41 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.174719 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4567  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.41 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.285336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2869  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.61 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1235  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.14 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0258  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.17 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00110621  normal  0.0541025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3097  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.04 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000199412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0330  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  21.74 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0194549  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2573  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.61 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0240809  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0310  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  21.74 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000118621  hitchhiker  0.00308805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1918  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.25 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.155378 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3111  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.61 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0012  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.61 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000129215  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2776  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  21.74 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0369347  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0604  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.88 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3429  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  21.74 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000277081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0007  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.61 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0428065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3775  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.61 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000463848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3836  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.61 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.234443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0987  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.71 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3369  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.48 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0810  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.71 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2491  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.89 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000434255  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0221  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.47 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0165647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0377  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.72 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000718544  hitchhiker  0.00146399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3945  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.12 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422329  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1506  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.54 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.54343  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2608  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.41 
 
 		 345 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3206  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.47 
 
 		 334 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3159  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.5 
 
 		 306 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2886  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaI subunit  24.37 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3574  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.84 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.520035 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1985  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.9 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0369582  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1907  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaG subunit  25.35 
 
 		 317 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3072  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.49 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.164872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3641  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.54 
 
 		 355 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4073  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  26.06 
 
 		 353 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0708903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1238  phenylacetate-CoA oxygenase PaaG subunit  23.94 
 
 		 352 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4472  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  26.06 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1824  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.07 
 
 		 327 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4289  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.54 
 
 		 328 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00273791  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7199  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.41 
 
 		 337 aa  52  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1756  phenylacetic acid catabolic  21.69 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000367689  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09290  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.6 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3735  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  21.28 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261938  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1475  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.13 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2267  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.13 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26530  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.96 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185661  normal  0.154279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1573  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.91 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1744  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  25.41 
 
 		 357 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0896  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.46 
 
 		 331 aa  48.9  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1752  phenylacetic acid catabolic  26.92 
 
 		 276 aa  48.5  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4147  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.81 
 
 		 333 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.611759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0691  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.07 
 
 		 333 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.965627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2198  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaG subunit  23.47 
 
 		 314 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2964  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.54 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6692  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  24.88 
 
 		 311 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3218  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  21.65 
 
 		 335 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0166533  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1443  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  23.94 
 
 		 320 aa  45.8  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2481  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaG subunit  23.94 
 
 		 324 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0753  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.48 
 
 		 332 aa  45.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4174  phenylacetic acid catabolic family protein  19.34 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.571745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3356  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  21.59 
 
 		 334 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4810  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.17 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.853346 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2833  phenylacetic acid catabolic family protein  21 
 
 		 311 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20150  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  22.73 
 
 		 335 aa  42  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>