21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2902 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2902  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  460  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0615892  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1252  hypothetical protein  93.33 
 
 
225 aa  427  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2751  hypothetical protein  80.72 
 
 
225 aa  368  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0312385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1320  hypothetical protein  77.92 
 
 
233 aa  367  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2823  hypothetical protein  77.49 
 
 
232 aa  364  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2581  hypothetical protein  77.92 
 
 
233 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  78.92 
 
 
224 aa  361  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3213  hypothetical protein  33.18 
 
 
173 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.052023 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2656  hypothetical protein  29.63 
 
 
196 aa  95.9  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3212  hypothetical protein  31.63 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0850  hypothetical protein  49.25 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272158  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_003296  RS03903  hypothetical protein  43.24 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3211  hypothetical protein  60.87 
 
 
68 aa  62  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1147  hypothetical protein  38.46 
 
 
136 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2334  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.777792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2070  hypothetical protein  36.51 
 
 
127 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.981444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1451  hypothetical protein  44.44 
 
 
136 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1524  hypothetical protein  40.62 
 
 
173 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0240  hypothetical protein  47.76 
 
 
85 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2529  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2943  hypothetical protein  35.38 
 
 
136 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>