23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2581 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2581  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1320  hypothetical protein  99.14 
 
 
233 aa  472  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2823  hypothetical protein  90.48 
 
 
232 aa  428  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2751  hypothetical protein  90.99 
 
 
225 aa  428  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0312385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  84.85 
 
 
224 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2902  hypothetical protein  77.92 
 
 
225 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0615892  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1252  hypothetical protein  76.52 
 
 
225 aa  355  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2656  hypothetical protein  32.33 
 
 
196 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3213  hypothetical protein  33.48 
 
 
173 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.052023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3212  hypothetical protein  30.13 
 
 
193 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03903  hypothetical protein  50.68 
 
 
115 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0850  hypothetical protein  51.35 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272158  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2070  hypothetical protein  41.27 
 
 
127 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.981444 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3211  hypothetical protein  45.83 
 
 
68 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1451  hypothetical protein  43.75 
 
 
136 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2334  hypothetical protein  32.65 
 
 
108 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.777792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1147  hypothetical protein  35.94 
 
 
136 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1524  hypothetical protein  43.75 
 
 
173 aa  51.6  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2943  hypothetical protein  33.85 
 
 
136 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2529  hypothetical protein  41.82 
 
 
70 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0798  hypothetical protein  34.69 
 
 
117 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.249703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0240  hypothetical protein  46 
 
 
85 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0838  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  45.1  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.011638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>