23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1320 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1320  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2581  hypothetical protein  99.14 
 
 		 233 aa  472  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2823  hypothetical protein  90.48 
 
 		 232 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2751  hypothetical protein  90.99 
 
 		 225 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  84.85 
 
 		 224 aa  394  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2902  hypothetical protein  77.92 
 
 		 225 aa  367  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0615892  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1252  hypothetical protein  76.52 
 
 		 225 aa  356  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3213  hypothetical protein  33.04 
 
 		 173 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.052023 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2656  hypothetical protein  31.47 
 
 		 196 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3212  hypothetical protein  30.13 
 
 		 193 aa  85.1  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03903  hypothetical protein  50.68 
 
 		 115 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0850  hypothetical protein  51.35 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272158  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3211  hypothetical protein  48.61 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2070  hypothetical protein  41.27 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.981444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1451  hypothetical protein  43.75 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2334  hypothetical protein  32.65 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.777792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1147  hypothetical protein  35.94 
 
 		 136 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2943  hypothetical protein  33.85 
 
 		 136 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1524  hypothetical protein  43.75 
 
 		 173 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545795 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2529  hypothetical protein  41.82 
 
 		 70 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0798  hypothetical protein  34.69 
 
 		 117 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.249703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0240  hypothetical protein  48 
 
 		 85 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0838  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.011638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>