19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1524 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1524  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  340  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545795 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0174  hypothetical protein  48.48 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1252  hypothetical protein  40.62 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3213  hypothetical protein  32.57 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.052023 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2902  hypothetical protein  40.62 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0615892  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  45.31 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2823  hypothetical protein  45.31 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0850  hypothetical protein  32.14 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272158  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2656  hypothetical protein  29.84 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1320  hypothetical protein  43.75 
 
 		 233 aa  51.6  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2581  hypothetical protein  43.75 
 
 		 233 aa  51.6  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2751  hypothetical protein  42.19 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1147  hypothetical protein  35.9 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03903  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3212  hypothetical protein  44.59 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1451  hypothetical protein  42.19 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2943  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  44.3  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2529  hypothetical protein  45.45 
 
 		 70 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2070  hypothetical protein  33 
 
 		 127 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.981444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>