21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03903 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03903  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  236  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3213  hypothetical protein  67.23 
 
 
173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.052023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0850  hypothetical protein  73.21 
 
 
164 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272158  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3212  hypothetical protein  73.42 
 
 
193 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2656  hypothetical protein  51.88 
 
 
196 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2751  hypothetical protein  45.24 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0312385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1451  hypothetical protein  60.87 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2581  hypothetical protein  44.05 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1320  hypothetical protein  44.05 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2943  hypothetical protein  52.94 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  41.67 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1147  hypothetical protein  49.3 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2823  hypothetical protein  41.67 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2070  hypothetical protein  47.76 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.981444 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2902  hypothetical protein  43.24 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0615892  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2334  hypothetical protein  41.77 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.777792 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1252  hypothetical protein  41.89 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2529  hypothetical protein  48.98 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0798  hypothetical protein  49.21 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.249703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0838  hypothetical protein  46.03 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.011638  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1524  hypothetical protein  36.54 
 
 
173 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>