22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1252 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1252  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2902  hypothetical protein  93.33 
 
 		 225 aa  427  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0615892  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2751  hypothetical protein  80.18 
 
 		 225 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  78.83 
 
 		 224 aa  360  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1320  hypothetical protein  76.52 
 
 		 233 aa  356  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2581  hypothetical protein  76.52 
 
 		 233 aa  355  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2823  hypothetical protein  76.52 
 
 		 232 aa  355  3.9999999999999996e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2656  hypothetical protein  31.8 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3213  hypothetical protein  32.6 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.052023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3212  hypothetical protein  30.88 
 
 		 193 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0850  hypothetical protein  49.25 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272158  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_003296  RS03903  hypothetical protein  41.89 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3211  hypothetical protein  60.87 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1147  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2334  hypothetical protein  35.71 
 
 		 108 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.777792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2070  hypothetical protein  36.51 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.981444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1524  hypothetical protein  40.62 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545795 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1451  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2529  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0240  hypothetical protein  42.42 
 
 		 85 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2943  hypothetical protein  35.38 
 
 		 136 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03902  hypothetical protein  43.75 
 
 		 56 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>