25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0209 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0209  hypothetical protein  100 
 
 
1131 aa  2239    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  25.82 
 
 
700 aa  119  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  28.36 
 
 
633 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1072  hypothetical protein  27.99 
 
 
851 aa  75.1  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.635494  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  29.07 
 
 
510 aa  72  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1312  hypothetical protein  25.94 
 
 
1076 aa  71.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  25.35 
 
 
863 aa  70.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  33.61 
 
 
882 aa  63.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  27.47 
 
 
707 aa  63.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  25.89 
 
 
860 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  29.55 
 
 
857 aa  62.4  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  24.24 
 
 
702 aa  61.6  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  25.9 
 
 
888 aa  58.9  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4479  hypothetical protein  22.79 
 
 
1057 aa  57  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926817  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  24.48 
 
 
847 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  23.72 
 
 
854 aa  55.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  26.14 
 
 
712 aa  50.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1845  hypothetical protein  25.45 
 
 
1068 aa  48.9  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.725746  normal  0.580829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2186  hypothetical protein  25.45 
 
 
1066 aa  48.5  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.222967  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1791  hypothetical protein  25.45 
 
 
1070 aa  48.1  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.684722  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2064  hypothetical protein  26.05 
 
 
1086 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4966  hypothetical protein  22.44 
 
 
1093 aa  47  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2291  hypothetical protein  24.87 
 
 
863 aa  47  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0813621  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2591  hypothetical protein  24.21 
 
 
863 aa  46.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  24.02 
 
 
863 aa  45.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>