16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1312 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1312  hypothetical protein  100 
 
 		 1076 aa  2106    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4479  hypothetical protein  35.18 
 
 		 1057 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1072  hypothetical protein  38.4 
 
 		 851 aa  456  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.635494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1071  hypothetical protein  41.18 
 
 		 137 aa  89.4  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.107343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4966  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1093 aa  88.6  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  25.89 
 
 		 700 aa  78.6  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0209  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1131 aa  71.2  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  25.82 
 
 		 633 aa  70.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  24.56 
 
 		 863 aa  54.3  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  24.85 
 
 		 860 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2384  hypothetical protein  23.05 
 
 		 873 aa  51.6  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1307 aa  50.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  23.46 
 
 		 847 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1104 aa  50.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  23.46 
 
 		 854 aa  48.9  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  22.69 
 
 		 510 aa  47.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>