11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1072 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 851 aa  1647    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.635494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1312  hypothetical protein  38.2 
 
 		 1076 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4479  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1057 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0209  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1131 aa  79.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4966  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1093 aa  77.8  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  24 
 
 		 700 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  24.77 
 
 		 510 aa  55.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  22.51 
 
 		 633 aa  50.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1104 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  25.63 
 
 		 860 aa  45.8  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  30 
 
 		 1307 aa  45.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>