37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1917 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1016    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  41.71 
 
 
863 aa  274  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  36.08 
 
 
860 aa  269  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  35.04 
 
 
847 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  35.04 
 
 
854 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  29.73 
 
 
633 aa  96.7  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  28.79 
 
 
702 aa  95.1  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  27.27 
 
 
888 aa  90.9  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  24.14 
 
 
857 aa  90.1  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  27.32 
 
 
891 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  28.02 
 
 
707 aa  87  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  27.27 
 
 
712 aa  86.7  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0618  hypothetical protein  24.19 
 
 
673 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0209  hypothetical protein  29.07 
 
 
1131 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1120  hypothetical protein  27.46 
 
 
688 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000538221  normal  0.614169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2187  hypothetical protein  26.4 
 
 
1108 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  23.6 
 
 
882 aa  70.5  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2186  hypothetical protein  27.37 
 
 
1066 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.222967  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1845  hypothetical protein  27.37 
 
 
1068 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.725746  normal  0.580829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1791  hypothetical protein  27.37 
 
 
1070 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.684722  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  28.43 
 
 
1104 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  25.25 
 
 
700 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1481  hypothetical protein  25.48 
 
 
1100 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342651  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  25.64 
 
 
863 aa  67.4  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2427  hypothetical protein  26.11 
 
 
1154 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0924938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2434  hypothetical protein  26.11 
 
 
1148 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.491363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2545  hypothetical protein  26.11 
 
 
1120 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.960719  normal  0.0399031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1924  hypothetical protein  26.11 
 
 
1164 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787497  normal  0.0260112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2064  hypothetical protein  25.84 
 
 
1086 aa  66.6  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2698  hypothetical protein  27.37 
 
 
1205 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737361  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1914  hypothetical protein  28.75 
 
 
1134 aa  63.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167412  normal  0.675287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  30.29 
 
 
1307 aa  63.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2110  hypothetical protein  27.7 
 
 
1222 aa  59.3  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1072  hypothetical protein  24.88 
 
 
851 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.635494  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1312  hypothetical protein  22.69 
 
 
1076 aa  47  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4479  hypothetical protein  22.89 
 
 
1057 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926817  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2291  hypothetical protein  23.33 
 
 
863 aa  44.3  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0813621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>