40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1205 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  100 
 
 
702 aa  1428    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  37.85 
 
 
712 aa  485  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  36.43 
 
 
707 aa  452  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  36.64 
 
 
888 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  36.83 
 
 
891 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1120  hypothetical protein  28.93 
 
 
688 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000538221  normal  0.614169 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  30.79 
 
 
857 aa  232  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  28.79 
 
 
510 aa  95.1  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  29.51 
 
 
854 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  28.96 
 
 
847 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  32.57 
 
 
882 aa  84.3  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  27.33 
 
 
863 aa  83.2  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  28.49 
 
 
860 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  30.94 
 
 
700 aa  74.3  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  29.8 
 
 
1307 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2698  hypothetical protein  28.89 
 
 
1205 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737361  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1481  hypothetical protein  29.05 
 
 
1100 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342651  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  24.86 
 
 
1104 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1914  hypothetical protein  28.95 
 
 
1134 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167412  normal  0.675287 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2110  hypothetical protein  27.17 
 
 
1222 aa  62.4  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0209  hypothetical protein  24.24 
 
 
1131 aa  61.6  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  24.57 
 
 
863 aa  60.5  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2187  hypothetical protein  23.03 
 
 
1108 aa  58.9  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87239  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2064  hypothetical protein  24.58 
 
 
1086 aa  58.2  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1845  hypothetical protein  23.6 
 
 
1068 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.725746  normal  0.580829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2186  hypothetical protein  23.6 
 
 
1066 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.222967  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2427  hypothetical protein  22.47 
 
 
1154 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0924938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1791  hypothetical protein  23.6 
 
 
1070 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.684722  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  26.11 
 
 
633 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2434  hypothetical protein  22.47 
 
 
1148 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.491363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2545  hypothetical protein  21.84 
 
 
1120 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.960719  normal  0.0399031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0618  hypothetical protein  24.47 
 
 
673 aa  56.6  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1924  hypothetical protein  22.47 
 
 
1164 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787497  normal  0.0260112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1636  hypothetical protein  25.29 
 
 
1058 aa  55.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0361894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2599  hypothetical protein  25.13 
 
 
870 aa  52  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2291  hypothetical protein  22.34 
 
 
863 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0813621  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2591  hypothetical protein  21.28 
 
 
863 aa  46.6  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1919  hypothetical protein  22.82 
 
 
904 aa  45.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1809  hypothetical protein  22.82 
 
 
910 aa  43.9  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2213  hypothetical protein  22.82 
 
 
898 aa  43.9  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.139058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>