43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3336 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  100 
 
 		 860 aa  1663    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  41.03 
 
 		 863 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  38.85 
 
 		 854 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  39.19 
 
 		 847 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  36.08 
 
 		 510 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2064  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1086 aa  101  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1481  hypothetical protein  34.06 
 
 		 1100 aa  98.2  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2187  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1108 aa  97.4  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87239  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1791  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1070 aa  97.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.684722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1845  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1068 aa  97.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.725746  normal  0.580829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2186  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1066 aa  95.5  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.222967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  34.01 
 
 		 1307 aa  94  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2110  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1222 aa  93.2  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  35.2 
 
 		 1104 aa  92.8  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2545  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1120 aa  92  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.960719  normal  0.0399031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1924  hypothetical protein  34.44 
 
 		 1164 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787497  normal  0.0260112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2427  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1154 aa  91.3  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0924938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2434  hypothetical protein  34.44 
 
 		 1148 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.491363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2698  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1205 aa  90.5  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0618  hypothetical protein  26.16 
 
 		 673 aa  90.1  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1914  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1134 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167412  normal  0.675287 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  26.86 
 
 		 888 aa  80.9  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  28.49 
 
 		 702 aa  80.5  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  26.67 
 
 		 891 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  26.26 
 
 		 707 aa  79.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  29.36 
 
 		 633 aa  77.4  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  26.06 
 
 		 863 aa  75.1  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1636  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1058 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0361894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  26.29 
 
 		 712 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1120  hypothetical protein  31.13 
 
 		 688 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000538221  normal  0.614169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  29.07 
 
 		 882 aa  69.7  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  22.91 
 
 		 857 aa  65.1  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0209  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1131 aa  63.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2599  hypothetical protein  27.01 
 
 		 870 aa  57.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  31.76 
 
 		 700 aa  57.4  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1919  hypothetical protein  27.41 
 
 		 904 aa  54.7  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2591  hypothetical protein  24.22 
 
 		 863 aa  54.3  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1809  hypothetical protein  27.41 
 
 		 910 aa  53.5  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2213  hypothetical protein  27.41 
 
 		 898 aa  53.5  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1780  hypothetical protein  23.3 
 
 		 867 aa  52.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2291  hypothetical protein  22.57 
 
 		 863 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0813621  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4479  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1057 aa  52  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1312  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1076 aa  51.2  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>