28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1743 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1743  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
64 aa  121  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0439637  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0159  4-oxalocrotonate tautomerase  89.06 
 
 
64 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0523793 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0719  4-oxalocrotonate tautomerase  89.06 
 
 
64 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.5068  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0009  4-oxalocrotonate tautomerase  74.14 
 
 
63 aa  85.1  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1055  4-oxalocrotonate tautomerase  53.12 
 
 
66 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1510  4-oxalocrotonate tautomerase  54.24 
 
 
61 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.258565  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  54.1 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2466  4-oxalocrotonate tautomerase  56.67 
 
 
61 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1542  4-oxalocrotonate tautomerase  54.24 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000358699  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0079  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
62 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000137411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2180  4-oxalocrotonate tautomerase  55.74 
 
 
63 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0810  4-oxalocrotonate tautomerase  38.98 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267524  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2976  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
62 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.854525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1332  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000185416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.42 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  32.31 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  42.37 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>