15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0079 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0079  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 62 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000137411  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1743  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0439637  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0719  4-oxalocrotonate tautomerase  48.33 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.5068  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0009  4-oxalocrotonate tautomerase  49.12 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235995  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0159  4-oxalocrotonate tautomerase  48.33 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0523793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1510  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2466  4-oxalocrotonate tautomerase  50.82 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1055  4-oxalocrotonate tautomerase  49.12 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1542  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000358699  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2180  4-oxalocrotonate tautomerase  46.77 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0810  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 61 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.71 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>