15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2687 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2687  peptidase domain-containing protein  100 
 
 
747 aa  1496    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1690  hypothetical protein  26.24 
 
 
533 aa  68.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.095239  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  24.08 
 
 
608 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3823  hypothetical protein  29.34 
 
 
529 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000781142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1170  peptidase domain protein  40 
 
 
155 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1197  peptidase domain protein  40 
 
 
155 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  24.15 
 
 
789 aa  51.2  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  24.15 
 
 
789 aa  51.2  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  24.6 
 
 
603 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3822  hypothetical protein  46.3 
 
 
490 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  25.24 
 
 
610 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3224  peptidase domain protein  37.93 
 
 
149 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0975  peptidase  41.07 
 
 
152 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.181276  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  27.32 
 
 
2334 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3711  peptidase-like  38.82 
 
 
232 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>