26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1530 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1530  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  473  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000147864  normal  0.0283625 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1534  hypothetical protein  36.4 
 
 
211 aa  95.9  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000101739  normal  0.014347 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1532  hypothetical protein  31.43 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000205669  normal  0.0294417 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1541  hypothetical protein  54.72 
 
 
160 aa  62.4  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000440251  hitchhiker  0.0000169675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0298  hypothetical protein  50.88 
 
 
236 aa  55.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.186262  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0267  hypothetical protein  60.98 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.93762  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0296  hypothetical protein  52.08 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.635456  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  27.45 
 
 
152 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0297  hypothetical protein  62.5 
 
 
229 aa  52  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.497298  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2376  hypothetical protein  25.91 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000807827  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  33.55 
 
 
169 aa  48.5  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  41.38 
 
 
151 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0291  Protein of unknown function DUF1628  42 
 
 
176 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0251  hypothetical protein  24 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00204328  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  40.91 
 
 
131 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0791  Protein of unknown function DUF1628  40.38 
 
 
157 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0792  Protein of unknown function DUF1628  42.55 
 
 
136 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1635  Protein of unknown function DUF1628  38.89 
 
 
136 aa  46.2  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0310  hypothetical protein  36.73 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685599  normal  0.28293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1219  hypothetical protein  45.16 
 
 
128 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1959  Protein of unknown function DUF1628  29.51 
 
 
169 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  37.7 
 
 
128 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5010  hypothetical protein  48.78 
 
 
172 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1960  Protein of unknown function DUF1628  43.14 
 
 
161 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1466  hypothetical protein  31.94 
 
 
182 aa  42.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.82518  normal  0.0169363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>