112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3955 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3881  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 81 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0523394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3955  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 81 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0171157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3867  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 81 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.6502  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2313  F0F1 ATP synthase subunit C  98.75 
 
 		 81 aa  148  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11332  F0F1 ATP synthase subunit C  96.25 
 
 		 95 aa  121  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1250  ATP synthase F0, C subunit  86.42 
 
 		 81 aa  100  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2292  ATP synthase F0, C subunit  63.75 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1916  ATP synthase F0, C subunit  90.38 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4333  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 86 aa  94  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424603  normal  0.0350807 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0648  F0F1 ATP synthase subunit C  77.55 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.157082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  44.3 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  45.33 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  50 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  46.97 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  39.51 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  39.51 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  39.51 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  54.55 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  42.03 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  46.97 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  44.12 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  46.97 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  46.97 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  51.67 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  46.97 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  37.04 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  46.97 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  52 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  35.8 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  35.8 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  35.8 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  35.8 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  34.18 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  34.18 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  34.18 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  34.18 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  57.14 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  42.03 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  41.33 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  41.33 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3079  ATP synthase F0, C subunit  36.14 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268592  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2802  F0F1 ATP synthase subunit C  42.65 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0121478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  35.53 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0305  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000326733  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  39.51 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  32 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2749  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000357567  normal  0.274405 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  34.72 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3310  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.48515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  30.99 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  30.99 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.44 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  32.39 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0007  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.316069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  35.8 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  34.57 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  36.67 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0035  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00371718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3289  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.524691  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2874  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3032  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3899  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  32.39 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  30.99 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  41.82 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  30.99 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  32.39 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4467  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000500836  hitchhiker  0.00000000117641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  30.12 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  31.51 
 
 		 88 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  35.8 
 
 		 81 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  37.04 
 
 		 82 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  35.8 
 
 		 81 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  31.65 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5604  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5126  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00154985  normal  0.574958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  42.31 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5418  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.000148826 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3058  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2915  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5735  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000209098  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73300  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.731054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6361  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>