159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1250 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1250  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 81 aa  153  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11332  F0F1 ATP synthase subunit C  83.95 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3881  F0F1 ATP synthase subunit C  86.42 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0523394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3955  F0F1 ATP synthase subunit C  86.42 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0171157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3867  F0F1 ATP synthase subunit C  86.42 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.6502  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2292  ATP synthase F0, C subunit  68.42 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2313  F0F1 ATP synthase subunit C  86.25 
 
 		 81 aa  103  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1916  ATP synthase F0, C subunit  90.24 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4333  F0F1 ATP synthase subunit C  85.19 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424603  normal  0.0350807 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0648  F0F1 ATP synthase subunit C  79.59 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.157082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  47.83 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  46.05 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  43.48 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  50 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  45.59 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  50.77 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  38.27 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  38.27 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  41.98 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  41.98 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  38.27 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  40.51 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  48.33 
 
 		 77 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  44.07 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  52 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  35.8 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  35.8 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  35.8 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  35.8 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  36.71 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  36.71 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  36.71 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  52.83 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  35.8 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3310  F0F1 ATP synthase subunit C  43.94 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.48515  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3079  ATP synthase F0, C subunit  36.47 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2802  F0F1 ATP synthase subunit C  44.12 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0121478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0305  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000326733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2874  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0007  F0F1 ATP synthase subunit C  42.42 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.316069  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2749  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000357567  normal  0.274405 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  36.11 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3058  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2915  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5418  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.000148826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5604  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5126  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00154985  normal  0.574958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5735  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000209098  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5436  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3289  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.524691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73300  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.731054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  33.8 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5205  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5300  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371709  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6361  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  35.53 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0035  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00371718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3899  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3032  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  40.3 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  39.13 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4467  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000500836  hitchhiker  0.00000000117641 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  39.13 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  39.51 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3930  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0039435  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4022  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0586605  normal  0.864238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4050  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4512  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00265019  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4135  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000070467  hitchhiker  0.00469633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4903  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000000864371  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4371  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000250209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3850  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0401321  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4370  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00324113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4491  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000555437  hitchhiker  0.0000047604 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>