66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0648 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0648  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
87 aa  164  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.157082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2292  ATP synthase F0, C subunit  56.41 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11332  F0F1 ATP synthase subunit C  77.46 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1250  ATP synthase F0, C subunit  80.85 
 
 
81 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1916  ATP synthase F0, C subunit  82.98 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3955  F0F1 ATP synthase subunit C  77.46 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0171157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3881  F0F1 ATP synthase subunit C  77.46 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0523394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3867  F0F1 ATP synthase subunit C  77.46 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.6502  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2313  F0F1 ATP synthase subunit C  76.06 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4333  F0F1 ATP synthase subunit C  82.93 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424603  normal  0.0350807 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  49.25 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  46.97 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  45.9 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  45.33 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  54.72 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  54.72 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 
77 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  54.72 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  48 
 
 
77 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  41.27 
 
 
84 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  41.27 
 
 
84 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  35.44 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  39.68 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  36.62 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  38.1 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  30.38 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3079  ATP synthase F0, C subunit  39.39 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268592  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  47.83 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 
89 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  43.4 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  32 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  32 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  39.68 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2802  F0F1 ATP synthase subunit C  41.79 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0121478  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  30.67 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  40.91 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.89 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  30.67 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  30.67 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  30.67 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.65 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  32.47 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  32.43 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  40.35 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  42.59 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  34.55 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3310  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.48515  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0305  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000326733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>