19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2363 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2363  putative lipoprotein  100 
 
 
140 aa  284  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221035  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4283  putative lipoprotein  79.55 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.309945  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11373  lipoprotein lprD  65.38 
 
 
126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.282281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3826  putative lipoprotein  68.94 
 
 
126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155317  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3914  putative lipoprotein  68.18 
 
 
126 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132912  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3840  putative lipoprotein  67.42 
 
 
140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0692951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1975  Glucitol operon activator-like protein  56.93 
 
 
147 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1300  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.135235  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3537  hypothetical protein  40.97 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000060722  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24660  hypothetical protein  34.23 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.64549  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3956  hypothetical protein  33.58 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0019599  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3577  hypothetical protein  36.13 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5662  Glucitol operon activator-like protein  48.98 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4326  hypothetical protein  34.55 
 
 
224 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.922278  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4024  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0283  hypothetical protein  30.07 
 
 
180 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3346  hypothetical protein  32.03 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0055  hypothetical protein  36.62 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.231759  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  38.18 
 
 
265 aa  40  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.315818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>