19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3914 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3840  putative lipoprotein  99.21 
 
 
140 aa  255  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0692951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3914  putative lipoprotein  100 
 
 
126 aa  256  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132912  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3826  putative lipoprotein  98.41 
 
 
126 aa  251  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155317  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11373  lipoprotein lprD  67.72 
 
 
126 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.282281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4283  putative lipoprotein  71.97 
 
 
141 aa  158  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.309945  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2363  putative lipoprotein  71.21 
 
 
140 aa  154  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221035  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1975  Glucitol operon activator-like protein  54.55 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1300  hypothetical protein  41.86 
 
 
146 aa  84.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.135235  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24660  hypothetical protein  33.77 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.64549  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3537  hypothetical protein  35.21 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000060722  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3956  hypothetical protein  37.6 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0019599  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3577  hypothetical protein  38.52 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0055  hypothetical protein  38.93 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.231759  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4326  hypothetical protein  39.05 
 
 
224 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.922278  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5662  Glucitol operon activator-like protein  52.27 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0283  hypothetical protein  40.28 
 
 
180 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4024  hypothetical protein  34.31 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3346  hypothetical protein  32.28 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  53.12 
 
 
265 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.315818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>