19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3840 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3840  putative lipoprotein  100 
 
 		 140 aa  284  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0692951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3914  putative lipoprotein  99.21 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3826  putative lipoprotein  97.62 
 
 		 126 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155317  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11373  lipoprotein lprD  66.93 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.282281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4283  putative lipoprotein  71.21 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.309945  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2363  putative lipoprotein  70.45 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1975  Glucitol operon activator-like protein  53.79 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1300  hypothetical protein  41.86 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.135235  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24660  hypothetical protein  32.03 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.64549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3537  hypothetical protein  35.21 
 
 		 165 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000060722  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3956  hypothetical protein  37.6 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0019599  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3577  hypothetical protein  38.52 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0055  hypothetical protein  38.19 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.231759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4326  hypothetical protein  39.05 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.922278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5662  Glucitol operon activator-like protein  52.27 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0283  hypothetical protein  40.28 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4024  hypothetical protein  34.65 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3346  hypothetical protein  32.28 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  53.12 
 
 		 265 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>