17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3577 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3577  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  241  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3956  hypothetical protein  74.62 
 
 		 132 aa  189  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0019599  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4024  hypothetical protein  44.63 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1815  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000174188  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2363  putative lipoprotein  36.04 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.922278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3346  hypothetical protein  33.62 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11373  lipoprotein lprD  34.48 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.282281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3537  hypothetical protein  33.57 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000060722  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24660  hypothetical protein  27.42 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.64549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0055  hypothetical protein  31.75 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.231759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3826  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155317  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3840  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0692951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0283  hypothetical protein  30.77 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4283  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.309945  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3914  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  44.9 
 
 		 265 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>