19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0283 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0283  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  361  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4326  hypothetical protein  55.95 
 
 
224 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.922278  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3537  hypothetical protein  32.74 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000060722  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0055  hypothetical protein  31.1 
 
 
146 aa  61.6  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.231759  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4024  hypothetical protein  41.79 
 
 
125 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3956  hypothetical protein  31.37 
 
 
132 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0019599  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11373  lipoprotein lprD  33.72 
 
 
126 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.282281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4283  putative lipoprotein  37.21 
 
 
141 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.309945  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3840  putative lipoprotein  46 
 
 
140 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0692951  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3826  putative lipoprotein  41.43 
 
 
126 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155317  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3914  putative lipoprotein  46 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132912  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1815  hypothetical protein  41.18 
 
 
128 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000174188  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2363  putative lipoprotein  29.49 
 
 
140 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221035  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1975  Glucitol operon activator-like protein  29.14 
 
 
147 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24660  hypothetical protein  27.95 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.64549  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3577  hypothetical protein  31.58 
 
 
122 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3346  hypothetical protein  34.62 
 
 
140 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  53.57 
 
 
298 aa  41.6  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1300  hypothetical protein  26.67 
 
 
146 aa  41.2  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.135235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>