20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5662 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5662  Glucitol operon activator-like protein  100 
 
 		 156 aa  317  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24660  hypothetical protein  43.31 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.64549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3537  hypothetical protein  35.86 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000060722  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11373  lipoprotein lprD  37.76 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.282281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0283  hypothetical protein  33.81 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2363  putative lipoprotein  34.13 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1975  Glucitol operon activator-like protein  33.86 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1300  hypothetical protein  50.94 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.135235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4283  putative lipoprotein  48.84 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.309945  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3840  putative lipoprotein  48.84 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0692951  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3956  hypothetical protein  33.09 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0019599  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3826  putative lipoprotein  48.84 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155317  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3914  putative lipoprotein  48.84 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3577  hypothetical protein  28.36 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4024  hypothetical protein  30.99 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0055  hypothetical protein  32.67 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.231759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4326  hypothetical protein  27.2 
 
 		 224 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.922278  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04020  vesicle-mediated transport-related protein, putative  34.65 
 
 		 879 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1815  hypothetical protein  25.35 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000174188  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  51.43 
 
 		 306 aa  40.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>