29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0408 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0408  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  891    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2266  hypothetical protein  50 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000113487  normal  0.0819386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0158  hypothetical protein  45.64 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.418536 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1586  hypothetical protein  40.27 
 
 		 443 aa  333  4e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000507896  hitchhiker  0.00416523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0661  hypothetical protein  41.47 
 
 		 442 aa  319  5e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000499977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1941  hypothetical protein  33.89 
 
 		 479 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000577788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2181  hypothetical protein  38.46 
 
 		 306 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.175616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2476  hypothetical protein  33.68 
 
 		 450 aa  152  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1372  Protein of unknown function DUF516  28.95 
 
 		 444 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0227  Protein of unknown function DUF516  31.11 
 
 		 273 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.420083  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2934  Protein of unknown function DUF516  31.85 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0733  hypothetical protein  30.2 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00487772  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0902  hypothetical protein  30.05 
 
 		 493 aa  122  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.757817  normal  0.396557 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0095  hypothetical protein  34.46 
 
 		 267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.342459  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0231  hypothetical protein  29.02 
 
 		 254 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2781  Protein of unknown function DUF516  41.33 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1669  hypothetical protein  28.63 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.987983  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0809  hypothetical protein  27.45 
 
 		 254 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0387  hypothetical protein  32.56 
 
 		 258 aa  100  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0316  hypothetical protein  29.95 
 
 		 254 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0773  hypothetical protein  32.26 
 
 		 269 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0054  Protein of unknown function DUF516  32.37 
 
 		 238 aa  90.5  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0283934  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0640  hypothetical protein  29.35 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000906628  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0774  hypothetical protein  32.14 
 
 		 237 aa  72  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.0296069 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1544  hypothetical protein  29.84 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0140701 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1476  hypothetical protein  32.17 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1672  hypothetical protein  28.64 
 
 		 251 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000720356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  52.38 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  46.51 
 
 		 305 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>